Geenin ja alleelin etsiminen on käytännössä samaa. Tosin, kun selvitetään alleelia, täytyy olla koettimet kaikille eri alleeleille. Tällöin voidaan käyttää esim. mainitsemaasi DNA-sirua (sitä voidaan käyttää myös monen eri geenin etsimiseen). PCR:ää voidaan käyttää silloin, jos geeniä/alleelia halutaan myöhemmin tutkia lisää.