Geenikirjaston toiminta

Opiskelupaketti Foorumit Kurssi 5 Geenikirjaston toiminta

Esillä 2 viestiä, 1 - 2 (kaikkiaan 2)
  • Julkaisija
    Artikkelit
  • #3128
    Nimetön
    Ei-aktiivinen

    Hei,

    miten geenikirjasto käytännössä toimii kun se luodaan bakteereihin? Bakteerien elinikähän on aika lyhyt, joten ei ole takuuta että geenit pysyvät tallessa? Ja miten bakteerit voivat tuottaa lisää näitä geeniä joita halutaan tallentaa, jos joistain geeneistä ei ole poistettu introneita?

    Kiitos vastauksestasi
    :)

    #3132
    Jani Ijas
    Avainmestari

    Hei,

    käytännössä geenikirjasto luodaan tällä tavalla:
    1. Eliöstä, jonka perimä geenikirjastoon tulee, saadaan kudoskappale.
    2. Tässä kudoskappalessa olevat solut lyysataan (= hajotetaan) ja jäljelle jäävästä solujätteestä eristetään DNA. DNA:ta saadaan siis paljon, koska se eristetään todella monesta (geneettisesti identtisestä) solusta.
    3. DNA pilkotaan restriktioentsyymeillä ja DNA-pätkät liitetään kloonausvektoreihin. Kloonausvektorit ovat bakteerien plasmideja muistuttavia DNA-pätkiä. Liittämällä DNA kloonausvektoreihin saadaan rekombinanttiplasmideja.
    4. Rekombinanttiplasmidiliuos sekoitetaan bakteereita sisältävän liuoksen kanssa, jolloin osa bakteereista ottaa plasmidin/plasmideja itselleen (transformaatio).
    5. Bakteeri kohtelee rekombinanttiplasmideja kuin mitä tahansa muita plasmideja, eli se replikoi niitä. Se ei kuitenkaan tuota geenien koodaamia proteiineja, sillä plasmideissa ei ole promoottoreita (DNA-pätkiä, johon RNA-polymeraasi kiinnittyy). Bakteeri elelee tyytyväisenä ja jakautuu omia aikojaan ja rekombinanttiplasmidit kulkeutuvat jälkeläisille.

    Geenikirjastossa ei siis ole tarkoituskaan, että bakteeri tuottaisi geenien koodaamia proteiineja. Jos tätä haluttaisiin, niin kuten sanoit, geeni täytyisi käsitellä sellaiseksi, että bakteeri osaa sitä lukea (mm. intronit poistamalla). DNA:n replikaatioon ei siis vaadita, että sen tuottamaa proteiinia myös tuotetaan.

    Toivottavasti tästä oli apua!

Esillä 2 viestiä, 1 - 2 (kaikkiaan 2)
  • Sinun täytyy olla kirjautunut vastataksesi tähän aiheeseen.